终末阵线采用即时动作战斗系统，玩家通过虚拟摇杆控制机甲移动，右侧按钮用于施放技能、切换角色和冲刺操作。每个角色拥有耐久值和护盾条，护盾在未受攻击时可自动恢复，而耐久值一旦耗尽就会导致战斗失败。战斗中玩家可以切换场下后备角色上场，利用破防状态对敌人造成更高伤害，同时注意完美装填机制在换弹时准确触发能短时间内大幅提升输出效率。
角色养成系统涵盖升级、军衔和技能多个方面，升级通过消耗研修课程提升角色等级，军衔则需要同名碎片来解锁额外天赋和属性加成如能源上限或暴击伤害。技能分为主动战技、被动战技和天赋战技，其中被动战技需通过DNA解锁，天赋战技包括固定小队增益和军衔相关能力，玩家还可以在基因改造界面进行加点调整以强化基础属性或觉醒新技能。武器养成同样关键，品质从普通到SSR分级，越高品质的武器可突破星数越多，等级上限也更高。
资源管理涉及意识、商业凭证、联合币和量子结晶等类型，意识作为体力值每5分钟恢复1点，用于推进主线副本或材料关卡；商业凭证可购买意识来恢复体力；联合币是通用货币在商会中交易材料；量子结晶作为高级资源用于抽卡或其他稀有物品获取。合理分配这些资源对游戏进度至关重要，避免浪费以最大化收益。
角色获取主要通过游戏内卡池抽取完成，新手十连抽设有保底机制确保获得SSR角色。组建阵容时需考虑角色定位如火力、破盾或支援类型，合理搭配不同定位角色可以发挥团队协同效果，例如支援角色提供增益而破盾角色快速削减敌人护盾，玩家需根据战斗需求灵活调整阵容以应对各种挑战。
游戏还包含伊甸基地等特色系统，玩家可以在此通过设施如合成营养舱和无重力车间生产资源如意识药剂和迁跃助熔剂，设施升级能提高产量和储存上限。同时有多种活动模式如危机竞争和商会任务提供丰富奖励，帮助玩家加速角色成长和资源积累，熟悉这些机制能优化整体游戏体验。
